寇克等人作为嘉宾乘新企业号试航，途中收到救援任务……而在另一时空，索伦博士正阴谋毁灭星球，攻击企业号。唯一能够帮助新船长皮卡特来阻止索伦的，只有销声匿迹了78年的寇克船长。
特种兵雷军退伍多年后，带着家人来到混乱的菲莱讨生活，却在一次暴乱中意外失去妻女，自此整日活在未能救下家人的梦魇与愧疚中。为了找到凶手，雷军盘下位于库尔斯小镇华裔社区的天堂超市。12年如一日寻凶不得的雷军身心俱疲，直到一个平常的下午，隐匿于库尔斯小镇附近的M国安全屋突然遭到恐怖袭击，大批恐怖份子涌入，开始无差别的疯狂血洗小镇。危难时刻雷军挺身而出拯救幸存同胞，上演一场令人窒息的12小时生死大逃亡。被频频逼入生死绝境，压抑多年的雷军怒火中烧，一头受伤的野兽决定张开獠牙，隐于黑暗，开启最后一击……
故事发生在变形金刚的母星塞伯坦，聚焦变形金刚的青年时代，讲述汽车人领袖擎天柱（克里斯·海姆斯沃斯ChrisHemsworth配音）与霸天虎领袖威震天（布莱恩·泰里·亨利BrianTyreeHenry配音）从手足走向反目的故事，打响旷日持久的塞伯坦之战。
