寇克等人作为嘉宾乘新企业号试航，途中收到救援任务……而在另一时空，索伦博士正阴谋毁灭星球，攻击企业号。唯一能够帮助新船长皮卡特来阻止索伦的，只有销声匿迹了78年的寇克船长。
故事发生在变形金刚的母星塞伯坦，聚焦变形金刚的青年时代，讲述汽车人领袖擎天柱（克里斯·海姆斯沃斯ChrisHemsworth配音）与霸天虎领袖威震天（布莱恩·泰里·亨利BrianTyreeHenry配音）从手足走向反目的故事，打响旷日持久的塞伯坦之战。
